GoogleAnalyticsは、計測対象サイトに、どういったユーザーが訪れてどういう行動をしたかを見るツール。Search Consoleは、Google検索のサービス内において、ユーザーがどういう検索行動を起こしたかを見ています。なのでそもそもデータソースが違うということです。